東南大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院，建立于1976年，其前身為鐵道部所屬的原南京鐵道醫(yī)學(xué)院預(yù)防醫(yī)學(xué)系，1999年更名為南京鐵道醫(yī)學(xué)院公共衛(wèi)生學(xué)院，是全國(guó)鐵路系統(tǒng)衛(wèi)生防疫工作人才培養(yǎng)和科學(xué)研究的重要基地。2000年4月，南京鐵道醫(yī)學(xué)院與教育部直屬的重點(diǎn)大學(xué)----東南大學(xué)合并，組建新的東南大學(xué)，公共衛(wèi)生學(xué)院成為東南大學(xué)下設(shè)的二級(jí)院系之一。
　　公共衛(wèi)生學(xué)院現(xiàn)設(shè)有預(yù)防醫(yī)學(xué)和勞動(dòng)與社會(huì)保障（醫(yī)療保險(xiǎn)專業(yè)方向）2個(gè)本科專業(yè)。建有“公共衛(wèi)生與預(yù)防醫(yī)學(xué)”一級(jí)學(xué)科博士點(diǎn)；“公共衛(wèi)生與預(yù)防醫(yī)學(xué)”博士后科研流動(dòng)站；也是教育部批準(zhǔn)的首批開展公共衛(wèi)生碩士（MPH）培養(yǎng)試點(diǎn)單位之一。勞動(dòng)與社會(huì)保障專業(yè)（醫(yī)療保險(xiǎn)專業(yè)方向），是江蘇省教育廳批準(zhǔn)的省重點(diǎn)建設(shè)的特色專業(yè)，現(xiàn)設(shè)有社會(huì)保障學(xué)碩士點(diǎn)。
　　學(xué)院設(shè)有勞動(dòng)衛(wèi)生與環(huán)境衛(wèi)生學(xué)、營(yíng)養(yǎng)與食品衛(wèi)生學(xué)、流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)學(xué)和醫(yī)療保險(xiǎn)學(xué)等4個(gè)學(xué)科系；預(yù)防醫(yī)學(xué)、站車衛(wèi)生、醫(yī)療保險(xiǎn)、醫(yī)學(xué)應(yīng)用技術(shù)、傷害流行病學(xué)等5個(gè)研究所。“公共衛(wèi)生與預(yù)防醫(yī)學(xué)”一級(jí)學(xué)科為江蘇省一級(jí)學(xué)科重點(diǎn)學(xué)科，此外還有2個(gè)鐵道部重點(diǎn)學(xué)科，1個(gè)與省CDC共建的重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室。
　　學(xué)院擁有一支素質(zhì)優(yōu)良，數(shù)量、結(jié)構(gòu)合理的師資隊(duì)伍。教師中，現(xiàn)有博士生導(dǎo)師7人，教授（研究員）13人，副教授20人，其中擔(dān)任國(guó)家自然基金評(píng)審委員2人，教育部專業(yè)指導(dǎo)委員會(huì)委員2人，江蘇省333工程領(lǐng)軍人才2人，全國(guó)高校優(yōu)秀骨干教師1人，衛(wèi)生部國(guó)家食品安全風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估專家委員會(huì)委員1人。具有博士學(xué)位和在讀博士學(xué)位的教師占到教師總數(shù)的80%以上，一半以上的教師具有海外留學(xué)或研修的經(jīng)歷，此外學(xué)院還在國(guó)內(nèi)外著名專家學(xué)者中聘請(qǐng)了一批兼職教授、客座教授，在省市一級(jí)重點(diǎn)疾控中心聘請(qǐng)了十余位基地研究生導(dǎo)師。
　　學(xué)院秉承百年名校—東南大學(xué)“止于至善”的辦學(xué)理念，發(fā)揮東南大學(xué)以工為主，文理管醫(yī)藝多學(xué)科的資源優(yōu)勢(shì)，積極探索走醫(yī)工結(jié)合、精而強(qiáng)的特色發(fā)展之路，近幾年來，學(xué)院適當(dāng)控制本科生招生規(guī)模，大力發(fā)展研究生教育，不斷提高辦學(xué)層次和辦學(xué)水平，現(xiàn)有在校本科生約430人，博士、碩士研究生130人（不包括專業(yè)碩士）。在加強(qiáng)人才培養(yǎng)的同時(shí)，學(xué)院注重圍繞國(guó)家和區(qū)域經(jīng)濟(jì)社會(huì)發(fā)展的公共衛(wèi)生重大問題，積極開展科學(xué)研究，重點(diǎn)在環(huán)境與健康、納米毒理、太湖水環(huán)境治理、健康膳食干預(yù)、重大傳染病防治以及衛(wèi)生政策研究等方面形成了穩(wěn)定的研究方向。目前承擔(dān)有國(guó)家973、863計(jì)劃、國(guó)家自然基金，衛(wèi)生部重大專項(xiàng)、科技部支撐計(jì)劃以及省自然基金和國(guó)際合作課題等40余項(xiàng)。近五年來，獲得縱向科研經(jīng)費(fèi)3000余萬元。
　　學(xué)院擁有教學(xué)科研用房6000余平方米，建有教學(xué)實(shí)驗(yàn)中心、計(jì)算機(jī)中心和分析檢測(cè)中心以及SPF動(dòng)物實(shí)驗(yàn)室等，并建有“環(huán)境醫(yī)學(xué)工程”教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室和衛(wèi)生部批準(zhǔn)的保健功能食品檢驗(yàn)單位。
　　學(xué)院積極開展國(guó)內(nèi)外的學(xué)術(shù)交流，先后邀請(qǐng)美國(guó)、德國(guó)、澳大利亞以及香港、臺(tái)灣等國(guó)家和地區(qū)的多所高校的著名專家學(xué)者來院訪問交流，并積極選派青年教師前往國(guó)外著名高校訪問研修，與香港大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院建立了院際交流合作關(guān)系，與澳大利亞莫納什大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院在聯(lián)合培養(yǎng)方面開展了密切合作。
　　2009年，在教育部組織的全國(guó)高校與科研院所一級(jí)學(xué)科評(píng)估排名中，學(xué)院“公共衛(wèi)生與預(yù)防醫(yī)學(xué)”一級(jí)學(xué)科位列第9位。