20世紀(jì)50年代末，在全國“大辦農(nóng)業(yè)，大辦糧食”熱潮中，為適應(yīng)上海經(jīng)濟(jì)發(fā)展和文化建設(shè)的需要，上海市委作出了建立上海農(nóng)學(xué)院(上海交通大學(xué)農(nóng)業(yè)與生物學(xué)院前身)的決定。1959年，上海農(nóng)學(xué)院應(yīng)運(yùn)而生，校址設(shè)在松江縣(現(xiàn)松江區(qū))城北。這是上海市歷史上的第一所由地方政府主辦的高等農(nóng)業(yè)院校，掀開了上海高等農(nóng)業(yè)教育的新篇章。1963年8月，因國家出現(xiàn)經(jīng)濟(jì)、財(cái)政困難，上海農(nóng)學(xué)院停辦。1978年10月，上海農(nóng)學(xué)院在上海縣七寶(現(xiàn)屬閔行區(qū))恢復(fù)重建。1999年9月，上海農(nóng)學(xué)院并入上海交通大學(xué)，成立上海交通大學(xué)農(nóng)學(xué)院。2002年3月，更名為上海交通大學(xué)農(nóng)業(yè)與生物學(xué)院。2009年5月，進(jìn)入教育部、農(nóng)業(yè)部合作共建全國八所涉農(nóng)高校行列。
并校以來，學(xué)院緊密圍繞“創(chuàng)建世界一流農(nóng)科”戰(zhàn)略主線，形成并確立了“以農(nóng)為本、需求牽引、特色發(fā)展、爭(zhēng)創(chuàng)一流”的辦學(xué)指導(dǎo)思想，著力加強(qiáng)學(xué)科建設(shè)、培養(yǎng)與引進(jìn)高層次人才，努力提高辦學(xué)層次、提升人才培養(yǎng)質(zhì)量，各項(xiàng)事業(yè)取得了跨越式發(fā)展。學(xué)院現(xiàn)有全日制本科專業(yè)5個(gè)(植物科學(xué)與技術(shù)、動(dòng)物科學(xué)、園林、資源環(huán)境科學(xué)、食品科學(xué)與工程)，一級(jí)學(xué)科碩士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)7個(gè)(園藝學(xué)、畜牧學(xué)、生態(tài)學(xué)、食品科學(xué)與工程、風(fēng)景園林學(xué)、植物保護(hù)、農(nóng)業(yè)工程)，二級(jí)學(xué)科碩士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)2個(gè)(預(yù)防獸醫(yī)學(xué)、作物遺傳育種)，一級(jí)學(xué)科博士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)3個(gè)(園藝學(xué)、生態(tài)學(xué)、生物醫(yī)學(xué)工程)，專業(yè)碩士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)4個(gè)(農(nóng)業(yè)推廣、獸醫(yī)、風(fēng)景園林、食品工程)。擁有上海市重點(diǎn)學(xué)科1個(gè)(蔬菜學(xué))，建有蔬菜學(xué)、生態(tài)學(xué)博士后科研流動(dòng)站。教職工215人(專任教師135人)，其中正高職稱教師 50人，副高職稱教師56人，具有博士學(xué)位的教師124人(海外博士28人)，一年以上海外學(xué)習(xí)經(jīng)歷的教師94人，“長(zhǎng)江學(xué)者”特聘教授1人，講席教授6人。截至2013年9月，全日制在校生1084人，其中本科生603人、研究生481人(博士生178人)。
學(xué)院堅(jiān)持走“頂天”、“立地”“一體兩翼”式發(fā)展道路，以農(nóng)業(yè)與生物學(xué)院為實(shí)體，利用學(xué)校多學(xué)科優(yōu)勢(shì)，注重與工科、理科、醫(yī)科和管理學(xué)科的交叉融合，努力打造高層次的“頂天”科技創(chuàng)新隊(duì)伍，致力于農(nóng)業(yè)應(yīng)用基礎(chǔ)研究和開發(fā)研究，為農(nóng)業(yè)技術(shù)創(chuàng)新提供源頭;以掛靠學(xué)院的上海交通大學(xué)新農(nóng)村發(fā)展研究院為載體，探索農(nóng)業(yè)科技推廣專兼職隊(duì)伍長(zhǎng)效機(jī)制，加快建設(shè)高水平的“立地”農(nóng)業(yè)科技推廣隊(duì)伍，專注于農(nóng)業(yè)科研成果的轉(zhuǎn)化和推廣，為國家的農(nóng)業(yè)現(xiàn)代化和社會(huì)主義新農(nóng)村建設(shè)服務(wù)。學(xué)院圍繞現(xiàn)代農(nóng)業(yè)與人類健康，著力加強(qiáng)農(nóng)業(yè)科技創(chuàng)新、農(nóng)業(yè)科技推廣平臺(tái)基地建設(shè)，不斷提升科研水平和質(zhì)量，在農(nóng)業(yè)優(yōu)質(zhì)新品種與資源利用、食品安全與營養(yǎng)、農(nóng)業(yè)環(huán)境與生態(tài)安全保障、人獸共患疫病的防控、園林生態(tài)與景觀等多個(gè)方向形成特色�，F(xiàn)擁有新農(nóng)村發(fā)展研究院(國家級(jí))、農(nóng)業(yè)部都市農(nóng)業(yè)(南方)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、上海市獸醫(yī)生物技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、上海市食品安全工程技術(shù)研究中心等國家級(jí)、省部級(jí)研究基地。近三年(2011-2013)，科研到位經(jīng)費(fèi)總計(jì) 2.1億元，獲批千萬級(jí)國家項(xiàng)目3項(xiàng)，國家自然科學(xué)基金立項(xiàng)資助項(xiàng)目56項(xiàng)(重點(diǎn)項(xiàng)目2項(xiàng));發(fā)表SCI/EI論文433篇，專利授權(quán)(含軟件著作權(quán))194項(xiàng)，新品種審定24項(xiàng)。以我院為第一完成單位獲國家科技進(jìn)步獎(jiǎng)二等獎(jiǎng)1項(xiàng)，教育部科技進(jìn)步一等獎(jiǎng)2項(xiàng)，上海市科技進(jìn)步二等獎(jiǎng)1項(xiàng)。
學(xué)院積極探索綜合性大學(xué)農(nóng)科創(chuàng)新人才培養(yǎng)模式，高度重視學(xué)生創(chuàng)新精神和實(shí)踐能力培養(yǎng)。2009年，我院改革本科生招生辦法，啟動(dòng)實(shí)施提前批次招生，與上海市農(nóng)委簽訂聯(lián)合培養(yǎng)農(nóng)科人才協(xié)議，定向培養(yǎng)新農(nóng)村建設(shè)高端人才。2008、2010、2012年，學(xué)院學(xué)生牽頭組建的創(chuàng)業(yè)計(jì)劃項(xiàng)目連續(xù)三屆闖入“挑戰(zhàn)杯” (第六、第七、第八)中國大學(xué)生創(chuàng)業(yè)計(jì)劃大賽決賽，摘得2金1銀佳績(jī);2011年，推薦的科技創(chuàng)新項(xiàng)目獲第十二屆“挑戰(zhàn)杯”全國大學(xué)生科技作品競(jìng)賽二等獎(jiǎng);2011、2012、2013年連續(xù)三年獲評(píng)團(tuán)中央暑期社會(huì)實(shí)踐重點(diǎn)團(tuán)隊(duì)(2012年囊括學(xué)校僅有的2支團(tuán)中央重點(diǎn)團(tuán)隊(duì))，獲評(píng)上海市大學(xué)生暑期社會(huì)實(shí)踐活動(dòng)優(yōu)秀項(xiàng)目獎(jiǎng)多項(xiàng)，2012年獲評(píng)交大唯一的上海市社會(huì)實(shí)踐最佳項(xiàng)目獎(jiǎng)。
學(xué)院不斷深化對(duì)外合作與交流，先后與美國康奈爾大學(xué)、羅格斯大學(xué)、普渡大學(xué)、英國諾丁漢大學(xué)、英國皇家獸醫(yī)學(xué)院、荷蘭瓦格寧根大學(xué)、日本千葉大學(xué)、京都大學(xué)等30多個(gè)世界知名學(xué)校和科研機(jī)構(gòu)建立了良好的合作關(guān)系。建有中美食品安全聯(lián)合研究中心(科技部注冊(cè))、交大- 復(fù)旦- 諾丁漢植物生物技術(shù)研發(fā)中心、上海交通大學(xué)陸伯勛食品安全研究中心、上海交通大學(xué)-普渡大學(xué)惠斯特勒碳水化合物聯(lián)合研究中心等國際科研合作機(jī)構(gòu)。2004 年，學(xué)院率先與全球農(nóng)科排名第一的美國康奈爾大學(xué)農(nóng)業(yè)與生命學(xué)院形成戰(zhàn)略伙伴，后分別與羅格斯大學(xué)、普渡大學(xué)等知名院校簽訂了學(xué)生聯(lián)合培養(yǎng)協(xié)議。目前，已有20余名本科生通過2+2項(xiàng)目獲得了雙學(xué)位，并順利進(jìn)入耶魯大學(xué)、布朗大學(xué)等常青藤大學(xué)攻讀碩士、博士學(xué)位。學(xué)院還與日本住友化學(xué)株式會(huì)社、美國食品飲料和消費(fèi)品制造商協(xié)會(huì)等世界知名企業(yè)簽署了合作意向書，開展生態(tài)農(nóng)場(chǎng)和食品安全領(lǐng)域的合作。
風(fēng)雨兼程自強(qiáng)不息，承前啟后再創(chuàng)輝煌。展望未來，學(xué)院將堅(jiān)持“以農(nóng)為本、需求牽引、特色發(fā)展、爭(zhēng)創(chuàng)一流”的辦學(xué)指導(dǎo)思想，努力實(shí)現(xiàn)創(chuàng)建世界一流農(nóng)科的戰(zhàn)略目標(biāo)，通過學(xué)科、組織、人員三大結(jié)構(gòu)調(diào)整，以未來國家農(nóng)業(yè)發(fā)展的重大科技問題和戰(zhàn)略需求為導(dǎo)向，以創(chuàng)新的系所矩陣式混合組織結(jié)構(gòu)、團(tuán)隊(duì)制管理模式為核心，以“一體兩翼”的結(jié)構(gòu)模式，“頂天”、“立地”兩支隊(duì)伍為抓手，深化內(nèi)涵和質(zhì)量建設(shè)，凝練學(xué)科梯隊(duì)，構(gòu)建創(chuàng)新平臺(tái)，加速推動(dòng)跨越式發(fā)展，力爭(zhēng)早日躋身國內(nèi)外高水平農(nóng)科院校前列。