新疆大學(xué)數(shù)學(xué)與系統(tǒng)科學(xué)學(xué)院的前身是1952年新疆民族學(xué)院時成立的數(shù)理系。1962年成立了新疆大學(xué)數(shù)學(xué)系，2001年5月成立了新疆大學(xué)數(shù)學(xué)與系統(tǒng)科學(xué)學(xué)院。
　　新疆大學(xué)數(shù)學(xué)與系統(tǒng)科學(xué)學(xué)院自1957年招收第一屆本科生以來，在新疆?dāng)?shù)學(xué)界元老陳德璜教授、王曾貽教授的帶領(lǐng)下，在張華孝、盛其榮、張知難等教授的共同努力下，新疆大學(xué)數(shù)學(xué)系全面進入了本科層次，建立了基礎(chǔ)數(shù)學(xué)和計算數(shù)學(xué)的本科專業(yè)，并于1981年建立了基礎(chǔ)數(shù)學(xué)碩士點。80年代初期至90年代中期，化學(xué)圖論專家張�；�教授開創(chuàng)了新疆大學(xué)的圖論研究工作，同時開始了學(xué)科建設(shè)工作，并建立了應(yīng)用數(shù)學(xué)碩士點。1991年基礎(chǔ)數(shù)學(xué)被確定為自治區(qū)首批重點學(xué)科，相繼獲得了和應(yīng)用數(shù)學(xué)和計算數(shù)學(xué)碩士點。90年代中后期至今，孟吉翔教授和韓東教授堅持了學(xué)科建設(shè)的正確方向，建立了統(tǒng)計學(xué)本科專業(yè)，合并基礎(chǔ)數(shù)學(xué)、應(yīng)用數(shù)學(xué)建立了數(shù)學(xué)與應(yīng)用數(shù)學(xué)本科專業(yè)；將計算數(shù)學(xué)發(fā)展為信息與計算科學(xué)本科專業(yè)。并在學(xué)科建設(shè)上有了重大的發(fā)展，建立了數(shù)學(xué)博士后流動站、應(yīng)用數(shù)學(xué)博士點、應(yīng)用數(shù)學(xué)國家級重點學(xué)科、運籌學(xué)與控制論碩士點、概率論與數(shù)理統(tǒng)計碩士點、應(yīng)用數(shù)學(xué)國家第三批高等學(xué)校特色專業(yè)建設(shè)點、數(shù)學(xué)與應(yīng)用數(shù)學(xué)國家級理科培養(yǎng)基地。
　　新疆大學(xué)數(shù)學(xué)與系統(tǒng)科學(xué)學(xué)院現(xiàn)已擁有數(shù)學(xué)與應(yīng)用數(shù)學(xué)、信息與計算科學(xué)、統(tǒng)計學(xué)三個本科專業(yè)，應(yīng)用數(shù)學(xué)、基礎(chǔ)數(shù)學(xué)、計算數(shù)學(xué)、運籌學(xué)與控制論、概率論與數(shù)理統(tǒng)計五個碩士點，應(yīng)用數(shù)學(xué)博士點，數(shù)學(xué)學(xué)科博士后科研流動站，以及“數(shù)學(xué)與應(yīng)用數(shù)學(xué)”國家人才培養(yǎng)理科基地。“應(yīng)用數(shù)學(xué)”為國家級重點學(xué)科和新疆大學(xué)“211工程”重點學(xué)科，“數(shù)學(xué)與應(yīng)用數(shù)學(xué)”是國家級優(yōu)勢特色學(xué)科。形成了可培養(yǎng)各民族本科、碩士、博士和博士后四個層次的數(shù)學(xué)專門人才的一條龍教育體系。
　　新疆大學(xué)數(shù)學(xué)與系統(tǒng)科學(xué)學(xué)院現(xiàn)有教職工120余人，其中博士生導(dǎo)師8人,碩士生導(dǎo)師26人，教授17人，副教授41人，有博士學(xué)位的教師40人。享受政府津貼專家1人，自治區(qū)有突出貢獻優(yōu)秀專家2人，自治區(qū)教學(xué)名師3人，百千萬工程人才1人，新世紀優(yōu)秀人才支持計劃1人，天山學(xué)者2人。