自動(dòng)化學(xué)院的歷史可追溯到1953年“哈軍工”時(shí)期，它是在“哈軍工”時(shí)期的“海道測(cè)量”和“船電”兩個(gè)專(zhuān)業(yè)的基礎(chǔ)上發(fā)展壯大起來(lái)的。自動(dòng)化學(xué)院是我校教學(xué)和科研的支柱骨干單位之一，設(shè)有“自動(dòng)化”、“測(cè)控技術(shù)與儀器”、“電氣工程及其自動(dòng)化”、“探測(cè)制導(dǎo)與控制技術(shù)”、“生物醫(yī)學(xué)工程”5個(gè)本科專(zhuān)業(yè)，具有“控制理論與控制工程”、“導(dǎo)航、制導(dǎo)與控制”、“模式識(shí)別與智能系統(tǒng)”、“檢測(cè)技術(shù)與自動(dòng)化裝置”、“電力電子與電力傳動(dòng)”、“電力系統(tǒng)及其自動(dòng)化”、“精密儀器及機(jī)械”、“生物醫(yī)學(xué)工程”、“機(jī)械電子工程”9個(gè)碩士學(xué)位授予權(quán)，具有“控制理論與控制工程”、“導(dǎo)航、制導(dǎo)與控制”、“精密儀器及機(jī)械”3個(gè)博士學(xué)位授予權(quán)，具有一級(jí)學(xué)科“控制科學(xué)與工程”博士后科研流動(dòng)站、2001年“導(dǎo)航、制導(dǎo)與控制”學(xué)科被評(píng)為國(guó)家級(jí)重點(diǎn)學(xué)科。在國(guó)家“十五”“211工程”部門(mén)預(yù)審和立項(xiàng)中，“控制理論與控制工程”、“導(dǎo)航、制導(dǎo)與控制”兩學(xué)科被列為重點(diǎn)建設(shè)學(xué)科，投資建設(shè)經(jīng)費(fèi)達(dá)2300萬(wàn)元，目標(biāo)是達(dá)到國(guó)際先進(jìn)水平。

　　該學(xué)院現(xiàn)有教師136人，教授和研究員32人(其中博士生導(dǎo)師19人)，副教授和高級(jí)工程師39人。有40%的教師曾赴美國(guó)、德國(guó)、加拿大、英國(guó)、瑞典、日本等國(guó)家學(xué)習(xí)、進(jìn)修或合作研究。

　　該學(xué)院具有雄厚的科研實(shí)力和科研特色。近年來(lái)，獲國(guó)家級(jí)科技獎(jiǎng)12項(xiàng)，省部級(jí)獎(jiǎng)50多項(xiàng)。其中艦船減搖控制技術(shù)、微機(jī)組合導(dǎo)航技術(shù)達(dá)到國(guó)際先進(jìn)水平，處于國(guó)內(nèi)領(lǐng)先水平。在國(guó)內(nèi)外刊物及學(xué)術(shù)會(huì)議上發(fā)表學(xué)術(shù)論文600余篇，其中國(guó)際學(xué)術(shù)刊物或會(huì)議論文70余篇，國(guó)家級(jí)學(xué)術(shù)刊物250余篇，出版學(xué)術(shù)著作50余部。

　　該學(xué)院已為國(guó)家培養(yǎng)本科生3100余人，研究生485人，其中絕大部分已成為國(guó)家經(jīng)濟(jì)建設(shè)、國(guó)防建設(shè)、科學(xué)研究和高等教育等方面的骨干。目前在該學(xué)院就讀的本科生有1972人，碩士研究生305人，博士研究生134人，博士后研究人員11人。

　　該學(xué)院的學(xué)生除可獲得學(xué)校獎(jiǎng)學(xué)金及“特困生資助金”外，學(xué)院還設(shè)立了多種鼓勵(lì)學(xué)生學(xué)習(xí)的獎(jiǎng)勵(lì)基金。學(xué)生學(xué)習(xí)風(fēng)氣濃厚，每年有約40%的學(xué)生保送或考取碩士研究生。1998年以來(lái)，該學(xué)院已有11名本科生被派往日本學(xué)習(xí)。