吉首大學(xué)醫(yī)學(xué)院于2000年9月8日組建。1978年原湖南醫(yī)學(xué)院湘西分院并入吉首大學(xué)組建醫(yī)療系，1958年創(chuàng)辦的吉首衛(wèi)生學(xué)校于2000年9月并入吉首大學(xué)，與醫(yī)療系合并組建吉首大學(xué)醫(yī)學(xué)院。醫(yī)學(xué)院組建以后，在學(xué)校黨委行政的正確領(lǐng)導(dǎo)下，學(xué)院堅(jiān)持以教育教學(xué)為中心，本著“以學(xué)科建設(shè)為龍頭，以專業(yè)建設(shè)為基礎(chǔ)，以課程建設(shè)為核心，以隊(duì)伍建設(shè)為重點(diǎn)，以條件建設(shè)為保障”的工作思路，堅(jiān)持以質(zhì)量求生存，以改革為動(dòng)力，以特色樹形象，以上層次、上水平為目標(biāo)。強(qiáng)化師資隊(duì)伍建設(shè)，組建學(xué)科隊(duì)伍，提升教師教學(xué)與科研水平，加快辦學(xué)條件的改善，提高辦學(xué)層次，辦學(xué)實(shí)力不斷增強(qiáng)，教學(xué)科研水平不斷提升。2012年榮膺第一批卓越醫(yī)生教育培養(yǎng)計(jì)劃試點(diǎn)高校。
學(xué)院已建成一支結(jié)構(gòu)合理、素質(zhì)較高、敬業(yè)精神強(qiáng)的教師隊(duì)伍。在專任教師隊(duì)伍中，其中教授12人(含4名特聘教授)，副教授37人，博士與碩士38人，同時(shí)還聘請(qǐng)了中科院院士陸士新等8名知名醫(yī)學(xué)專家為學(xué)院兼職教授和客座教授。學(xué)院目前擁有生物化學(xué)與分子生物學(xué)(醫(yī)學(xué)方向)、運(yùn)動(dòng)人體科學(xué)(醫(yī)學(xué)方向)2個(gè)二級(jí)學(xué)科碩士點(diǎn)，開設(shè)有臨床醫(yī)學(xué)、護(hù)理學(xué)、針灸推拿學(xué)、醫(yī)學(xué)影像技術(shù)4個(gè)全日制本科專業(yè)，護(hù)理學(xué)和針灸推拿學(xué)2個(gè)全日制�？茖I(yè)，其中針灸推拿學(xué)專業(yè)具有留學(xué)生招生權(quán)。學(xué)生面向全國(guó)15個(gè)省(市)招生，在校學(xué)生數(shù)2700余人。
學(xué)院建有基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室和臨床技能實(shí)踐教學(xué)中心，均為中央與地方共建實(shí)驗(yàn)室，基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室于2007年順利通過(guò)了省教育廳的合格評(píng)估，臨床技能實(shí)踐教學(xué)中心于2012年通過(guò)了省級(jí)實(shí)踐教學(xué)示范中心評(píng)估，實(shí)驗(yàn)室總面積近8000平方米，擁有教學(xué)儀器設(shè)備1400萬(wàn)元。醫(yī)學(xué)研究所承擔(dān)著全校的醫(yī)學(xué)科研工作，并為湘、鄂、渝、黔四省市邊區(qū)提供醫(yī)藥科研的服務(wù)平臺(tái)。學(xué)院還建有劉氏小兒推拿生物信息實(shí)驗(yàn)室—國(guó)家二級(jí)實(shí)驗(yàn)室建設(shè)單位和劉氏學(xué)術(shù)體系研究室—湖南省中醫(yī)藥管理局重點(diǎn)研究室建設(shè)單位。學(xué)校現(xiàn)有附屬醫(yī)院2所，教學(xué)醫(yī)院4所，實(shí)習(xí)醫(yī)院16所，為醫(yī)學(xué)生理論教學(xué)和實(shí)踐教學(xué)提供了有力保障。
學(xué)院教師積極投入教學(xué)改革和科學(xué)研究，近年來(lái)共承擔(dān)包括國(guó)家自然科學(xué)基金、國(guó)家社科基金在內(nèi)的各級(jí)科研課題140余項(xiàng)，擁有在研科研經(jīng)費(fèi)400多萬(wàn)元，發(fā)表學(xué)術(shù)論文800余篇，出版專著及編寫教材50余部，獲得各類省、州、和校級(jí)成果獎(jiǎng)40余項(xiàng)。一批教師擔(dān)任著全國(guó)及全省各類學(xué)術(shù)要職。學(xué)院注重學(xué)生專業(yè)知識(shí)的學(xué)習(xí)和綜合素質(zhì)的培養(yǎng)，尤其注重基本操作技能的實(shí)訓(xùn)和專業(yè)實(shí)踐能力的培養(yǎng)，畢業(yè)生以其專業(yè)知識(shí)扎實(shí)、工作能力強(qiáng)、作風(fēng)樸實(shí)而深受用人單位的歡迎。